Mehanizem in biološke implikacije agregacije proteinov
Cilji
CILJI: Razumeti proces agregacije proteinov do amiloidnih fibril. Ti procesi se pojavljajo v nevrodegenerativnih boleznih, kot so Alzheimerjeva, Parkinsonova, razne demence in prionske bolezni. Z boljšim razumevanjem molekularnih in celičnih osnov proteinske agregacije bo možno priti do novih terapij za nevrodegenerativne bolezni. Predmet bo vključeval molekularne, celične in izbrane klinične vidike.
KOMPETENCE: Spoznavanje z interdisciplinarnimi področji molekularne in celične biologije, biokemije in biofizike. Samostojno mišljenje, formuliranje problemov in vprašanj.
Predmetnik
Poglavja:
1. Biofizikalne osnove agregacije proteinov. Modeli za amiloidno fibrilacijo proteinov.
2. Struktura amiloidnih fibril.
3. Eksperimentalne tehnike za študij termodinamike in kinetike procesa fibrilacije. Študij primerov iz literature: A-beta, beta-microglobulin, alfa-sinuklein, stefin B.
4. Korelacija med zvijanjem proteinov in tvorjenjem amiloidnih fibril. Vloga vmesnih stanj zvitja pri tvorbi amiloidov. Vloga šaperonov pri obrambi pred agregati.
5. Citotoksičnost amiloidnih fibril. Interakcija z lipidi in tvorjenje por.
6. Proteinska agregacija v celici. Akumulacija in transport agregatov. Čiščenje celice – razgradnja agregatov preko ubikvitin proteasomalnega sistema in autofagije.
7. Reverzibilna agregacija proteinov v telesca brez membran
8. Amiloidoze in nevrodegenerativne boleznim - Seminar.
Obveznosti
Končan študij druge stopnje biokemije, biologije, medicine, veterine ali katerekoli druge naravoslovne smeri.
Literatura in reference