Tradicionalne metode preučevanja virusov so omejene pri odkrivanju novih patogenov, vendar nedavni napredek na področju visoko zmogljivega sekvenciranja (HTS) to spreminja. Uporaba HTS omogoča poglobljeno analiyo viromov različnih gostiteljev in okolij ter odkrivanje znanih in neznanih vrst virusov. Kljub temu tarčni pristopi, kot je kvantitativna PCR, ostajajo zlati standard za …
Virusi, satelitni virusi, viroidi, virusoidi in satelitne nukleinske kisline (v tem odstavku poenostavljeno imenovani virusi) sestavljajo virosfero in so verjetno najbolj raznoliki in pogosti, a vendar premalo raziskani mikrobi na Zemlji. Najpogosteje jih obravnavamo kot patogene mikrobe ali parazite njihovih evkariontskih ali prokariontskih gostiteljev. V kmetijskih ekosistemih viruse poznamo zlasti …
Metagenomika, ki temelji na visokozmogljivem sekvenciranju (HTS), je omogočila novo obdobje odkrivanja in genomske karakterizacije virusov, povezanih z določenim gostiteljem ali okoljem. Iskanje novih virusnih sekvenc ponuja odlično priložnost za izboljšanje zgodnjega odkrivanja patogenov, za napovedovanje virusnih gostiteljev in okoljskih rezervoarjev pred pojavom pomembnih izbruhov bolezni. Študije virusov, ki temeljijo …