PREDMETI

Cilji

Splošne kompetence: - obvladanje raziskovalnih metod in postopkov, razvoj kritične in samokritične presoje, - sposobnost uporabe znanja v praksi, - razvoj komunikacijskih sposobnosti in spretnosti, posebej komunikacije v mednarodnem okolju, - kooperativnost, delo v skupini (in v mednarodnem okolju). Predmetnospecifične kompetence: Študent se bo seznanil s teoretičnimi osnovami proteomike in z njeno uporabo v biomedicinskih raziskavah. Pri svojem delu bo uporabljal najnovejšo tujo strokovno literaturo, kar bo izboljšalo njegove sposobnosti uporabe tujega jezika in kritičnega pogleda na objavljeno raziskovalno delo.

Predmetnik

Metode ločevanja proteinov: priprava vzorca, PAGE, 2D-PAGE, DIGE, HPLC, MudPIT, afinitetna kromatografija Masna spektrometrija: osnove masne spektrometrije, vrste in komponente masnih spektrometrov, MALDI, ESI, CID, ETD, ECD Kvantitativna proteomika: ICAT, SILAC, iTRAQ, absolutna kvantifikacija Bioinformatika: statistična obdelava podatkov, proteinske in genomske podatkovne baze, algoritmi za identifikacijo MS/MS spektrov, “de novo” sekveniranje Proteomika in reševanje bioloških problemov: “top down” in “bottom up” pristop, posttranslacijske modifikacije proteinov, proteinski kompleksi, biomarkerji