REPOZITORIJ > REZULTATI

Toksičnost, mobilnost in biološka dostopnost aluminija (Al) so odvisne od kemijskih zvrsti v kateri se Al nahaja. Da bi razumeli toksičnost in transport Al v človeškem telesu je potrebno identificirati in kvantificirati Al zvrsti (speciacije) prisotne v humanem serumu. To je vodilo do razvoja občutljivih in selektivnih analiznih metod za …

Proteaze so encimi, ki so odgovorni za ragradnjo peptidnih vezi v proteinskih oziroma peptidnih substratih, ki lahko ključno vplivajo na številne biološke procese. Zaradi tega mora biti proteolizna aktivnost proteaz natačno kontrolirana in uravnana. Nepravilno delovanje proteaz tako vodi do številnih bolezni. Bolezni sklepov delimo na vnetna, mednje sodi revmatoidni …

3-dimenzionalna struktura (makro)molekul je interpretacija merjenih podatkov. V primeru kristaliziranih molekul, gre pri tem za interpretacijo difrakcijskega vzorca kristalne mreže pridobljene s sipanjem rentgenskih žarkov na atomih v kristalu. Na srednji resoluciji difrakcijskih podatkov (2Å in nižje) smo pokazali, da povprečena elektronska gostota izračunana iz serije brcnjenih modelov lahko zmanjša …

Programirana celična smrt je aktiven proces, pri katerem večcelični organizmi odstranijo odvečne ali škodljive celice, kar je potrebno za normalen razvoj organizma. Obstaja več oblik programirane celične smrti, med katerimi je najbolj raziskana apoptoza. Značilne morfološke in biokemijske lastnosti umirajoče celice so posledica aktivnosti cisteinskih proteaz iz družine kaspaz. V …

Disertacija se z novo kombinacijo metod mestno specifičnega označevanja (SDSL), elektronske paramagnetne resonance (EPR) in modeliranja strukture proteina ter njegovih konformacijskih prostorov loteva problema določevanja struktur proteinov. Nov pristop je namenjen predvsem strukturni karakterizaciji membranskih in intrinzično neurejenih proteinov. V prvem delu disertacije so predstavljene izboljšave analize EPR spektrov s …

Število in raznolikost makromolekulskih struktur v kompleksih s hetero ligandi raste, s tem pa tudi potreba po hitri pripravi pravilnih geometrijskih parametrov za izboljševanje (refinement) ujemanja le-teh, saj primerjava ujemanja pokaže razlike, pogosto odločilne za razumevanje biološke pomembnosti struktur. Sedanji standard za opis geometrije proteinskih struktur je set Engh-Huberjevih parametrov. …

Kompleksne dinamične sisteme pogosto modeliramo v obliki omrežij, kjer vozli predstavljajo dinamične enote sistema, ki so sklopljene prek mrežnih povezav. Primer takšnega sistema je omrežje genske regulacije, ki uravnava tvorbo proteinov znotraj celice. Tu vozli sistema ustrezajo posameznim genom. Značilno za kompleksne dinamične sisteme je sodelavanje gradnikov na večih ravneh …

This thesis presents a study of different nanoscale functional properties of Mo6S9-XIx nanowires and demonstrates a straight-forward functionalization route based on self-assembly. In order to ascertain their basic functional properties, studies of dispersion and electromobility under different conditions were performed. It was found that the nanowire bundles, due to their …

Cisteinske peptidaze imajo vlogo virulenčnih dejavnikov pri mnogih praživalih, med drugim tudi pri parazitu Trypanosoma cruzi. Sekveniranje genoma tega organizma je nakazalo obstoj več novih družin cisteinskih peptidaz. Osredotočili smo se na dve družini: metakaspaze iz klana CD in avtofagine (oziroma Atg4 proteaze) iz klana CA. V svojem prejšnjem delu …